More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2970 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  58.05 
 
 		 325 aa  308  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  59.35 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  59.78 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.08 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.2 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.4 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  34.24 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 309 aa  92  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  32.6 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  45.36 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.86 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.65 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0687  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  26.57 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.12 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  37.43 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  41.77 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  35.86 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  36.36 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  33.64 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  29.63 
 
 		 1366 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  36.19 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 180 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  24.31 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 97 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  22.91 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  33.71 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 530 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  35.8 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  36.9 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  31.39 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  37.21 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>