More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4026 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  99.62 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  68.35 
 
 		 280 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  68.12 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  42.56 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  38.35 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.15 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.03 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.07 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  43 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.9 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  26.76 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.15 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  23.86 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  24.75 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  22.9 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  20.79 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  26.35 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0268  putative HTH-type transcriptional regulator YkgA  30.95 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00261  hypothetical protein  30.95 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00257  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.95 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3303  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0352  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0313  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  21.97 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3321  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4427  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3588  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0511949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3940  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  20.57 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  21.65 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0332  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  20.12 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 342 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  21.36 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  21.77 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  25.2 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.4 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>