196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4454 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  80.58 
 
 		 277 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  42.69 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  37.22 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.01 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.46 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.6 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.7 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.45 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.81 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  26.9 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.99 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  24 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  31.09 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  26.04 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  26.6 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  21.21 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  22.49 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 327 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  18.78 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  21.69 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  23.44 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 330 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  25.82 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 339 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0687  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 332 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 332 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 332 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.36 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.46 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  23.33 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  29.92 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  24.34 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  21.26 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>