More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0579 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
257 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  87.94 
 
 
256 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  85.21 
 
 
257 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.84 
 
 
255 aa  158  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 
253 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
271 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
278 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 
287 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  23.46 
 
 
272 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
289 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  32.18 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 
278 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  28.64 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.1 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.64 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  34.24 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 
292 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  24.15 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  33.18 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.54 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  28.51 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.42 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.38 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.7 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  30.25 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  22.09 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  23.94 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 
297 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  29.69 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 
299 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  38.39 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  23.95 
 
 
298 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  38.27 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.75 
 
 
281 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 
252 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
311 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 
307 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.6 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  23.13 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  33.73 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  35.71 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  33.15 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2338  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 
280 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 
304 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  32.99 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 
355 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2336  hypothetical protein  20.69 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>