More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3242 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  76.64 
 
 		 274 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  38.02 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  30.05 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.34 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.19 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  31.12 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  30.18 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.56 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.2 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.57 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.02 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  25.68 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  27.59 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  23.72 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  24.4 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.5 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.58 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  25.73 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  24.56 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  22.37 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.96 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.93 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.94 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 519 aa  58.9  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.93 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.78 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>