208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4542 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 265 aa  501  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 292 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  40.55 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.56 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  39.69 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.27 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  40.62 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 221 aa  99  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 229 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.92 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 327 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  27.41 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  26.82 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  21.48 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  31.98 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  38.59 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0509  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.01 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.591495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24.53 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  26.85 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  26.6 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.91 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  20.64 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.96 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  26.96 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.31 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  20.23 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.05 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  20.61 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  21.98 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  26.24 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.62 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  36.41 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  24.41 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  26.64 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.16 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  24.16 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  33.15 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  28.5 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  33.84 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  23.48 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  24.27 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.76 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  19.92 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>