More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6191 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 282 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  44.36 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  45.8 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  42.69 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  38.66 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.19 
 
 		 276 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.97 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  34.16 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  37.87 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.75 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.17 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.89 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  26.97 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.74 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  24.34 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  21.09 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  21.74 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.11 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  38.3 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  23.99 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  22.13 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.23 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  20.55 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 760 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2978  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.74 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  29.05 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 131 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  24.71 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  20.69 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 160 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 462 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  30.51 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0687  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>