133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2317 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2026  transcriptional regulator, AraC family  45.91 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0545338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05740  hypothetical protein  44.55 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2706  transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4632  AraC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3143  helix-turn-helix domain-containing protein  44.39 
 
 		 203 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.828512  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.55 
 
 		 289 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2398  cyclic nucleotide-binding protein  41.56 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  41.1 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5781  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.19 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 1121 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.94 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 143 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.59 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 131 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 278 aa  45.4  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  25.53 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3824  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  26.04 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.3 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>