112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1191 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 278 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 297 aa  281  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  24.45 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  23.47 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  36.71 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0433  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3644  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0627026  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2143  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  23.39 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1690  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 363 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 335 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 349 aa  48.9  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3867  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  43.06 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  23.78 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  27.37 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.63 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  21.85 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 354 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 339 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.89 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5231  helix-turn-helix domain-containing protein  29.89 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.41 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3824  transcriptional regulator, AraC family  30.26 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  36.36 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  32.5 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.58 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  33.77 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  33.77 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  32.58 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.23 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  29.67 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2706  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  29.09 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>