118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2325 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 249 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  56.56 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  49.14 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  41.8 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  43.15 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  21.82 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3326  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  39.02 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  21.52 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  22.78 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.81 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  21.36 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  23.35 
 
 		 299 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  28.65 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 313 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  23.2 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.82 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.89 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.98 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  22.78 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6130  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.87 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  21.49 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  20.47 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  21.77 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  23 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  22.18 
 
 		 305 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  23.37 
 
 		 282 aa  45.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  20.87 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 415 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  30.77 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  20.19 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  25.89 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  22.89 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4385  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.357896  decreased coverage  0.000854827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  21.77 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  26.37 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>