More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3326 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3326  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 307 aa  614  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.04 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.75 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  37.42 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  41.46 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  44.32 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.61 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  32.46 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  47.06 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  43.21 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  26 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  23.08 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.4 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.75 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 120 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 219 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 134 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  24.24 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  39 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6083  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.864918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  30.66 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  29.79 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 123 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0792  AraC family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 163 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  20.57 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6267  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  41.1 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 115 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  31.17 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  36.84 
 
 		 248 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 366 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  35.21 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 271 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>