More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0792 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0792  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595246 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 131 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 115 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  54 
 
 		 112 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6083  transcriptional regulator, AraC family  60.87 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.864918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 276 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 284 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 277 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 284 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 277 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0046  AraC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 131 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 279 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 277 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  47.31 
 
 		 272 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 277 aa  84  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  42.7 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  44.9 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  39.84 
 
 		 275 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 260 aa  80.5  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 290 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  43.88 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  44.21 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  44.33 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 312 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  35.78 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  37.4 
 
 		 275 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 276 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 264 aa  77.4  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  44.9 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  44.79 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  34.17 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40.87 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  46.07 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  41.94 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 293 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  38.27 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 303 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 300 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  42.72 
 
 		 281 aa  74.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 300 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 308 aa  74.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 275 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  40.95 
 
 		 298 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 278 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 278 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 272 aa  73.9  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 306 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 278 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 306 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  41.11 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  41.11 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 277 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 299 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>