More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2577 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 298 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  55.6 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  41.87 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  43.46 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  43.46 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  42.56 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  33.14 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  32.88 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.66 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 353 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  31.75 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  30.52 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  28.04 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  27.51 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  29.15 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  24.17 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  24.17 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  24.17 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  24.24 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 133 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 112 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>