More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7200 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  47.13 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.9 
 
 		 289 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  38.43 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  36.86 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.98 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  41.71 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  33.46 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.44 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  25.84 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  30.29 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  21.95 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.88 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  19.6 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.49 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  21.59 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  28.96 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  31.28 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  35.75 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  22.79 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.71 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  20.23 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.82 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  22.6 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  25 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  33.03 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  31.28 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.05 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.78 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  44.57 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  26.8 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  38.46 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>