130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0979 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.64 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 253 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.59 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.94 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  49.41 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  24.07 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  25.39 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  44.19 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  45.83 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  22.02 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  20.48 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  21.68 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  19.18 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  24.2 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  22.36 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  21.43 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 229 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  38.16 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  41.33 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.07 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  27.61 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  23.7 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2165  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  31.45 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  25.18 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  29.23 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  22.67 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6197  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.27 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.75 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.71 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  28.41 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.32 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  34.48 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  35.06 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  24.39 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>