More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1835 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  50.75 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  38.02 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  33.48 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  28.88 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.27 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.91 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  21.52 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  23 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  22.6 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  22.97 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  23.89 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  20.87 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  23.21 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.4 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  21.74 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  23.97 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  22.77 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  20.51 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  21.74 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.89 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  24.28 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  23.19 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  20.59 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.13 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  23.22 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  19.77 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  20.12 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  24.86 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  27.5 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  21.46 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  27.5 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2398  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  22.91 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  29.47 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  34.48 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  33.33 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  20.48 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  23.79 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  22.82 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  19.47 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.45 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  25.69 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  26.04 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  31.03 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 393 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>