More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0264 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 284 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  47.31 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  39.93 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  39.5 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  36.75 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.1 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.6 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.81 
 
 		 276 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 271 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.38 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.82 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  40.29 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  22.5 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  40 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  28.89 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  27.02 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.98 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  35.23 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.05 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.08 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  38.04 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  33.15 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  36.14 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  23.88 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  32.38 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  40 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4681  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399866  hitchhiker  0.000374446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  29.87 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  41.25 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  41.25 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  41.25 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  32.94 
 
 		 329 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 462 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 360 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 357 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  41.43 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>