216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2241 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  80.58 
 
 
280 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  68.12 
 
 
276 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  68.12 
 
 
276 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  67.82 
 
 
262 aa  348  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  41.04 
 
 
285 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
271 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.28 
 
 
284 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 
282 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 
271 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.66 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.04 
 
 
276 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 
246 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.16 
 
 
303 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.41 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  43.62 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.09 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  24.81 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 
272 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  30.71 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  24.3 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  24.14 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  23.71 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  25.44 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.33 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  24.06 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 
284 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 
277 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 
257 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  40.85 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  19.9 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  23.65 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.46 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.33 
 
 
272 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  22.62 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
257 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  28.45 
 
 
242 aa  48.9  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 
301 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 
266 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.76 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 
351 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  28.95 
 
 
274 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
299 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0687  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
336 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
281 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  25.86 
 
 
330 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>