More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2463 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 248 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.61 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.39 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  38.91 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  29.8 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.45 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  29.02 
 
 		 277 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.41 
 
 		 303 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 285 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.45 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  44.57 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  32.8 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  36.84 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  37.72 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  26.61 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  36.84 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  36.84 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  34.15 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 97 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  43.53 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  20.67 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  32.07 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  40.48 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  20.67 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  38.26 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  39.53 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>