278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000237 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  35.66 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  28.95 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  25.59 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  23.25 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 304 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  22.68 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  23.25 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1069  hypothetical protein  41.24 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  24.52 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.71 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  23.74 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  21.45 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.77 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  21.83 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  24.03 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  24.16 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  22.66 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.14 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3644  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 379 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0627026  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.31 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  28.45 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  35.64 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1690  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 363 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.91 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  21.45 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.48 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  30.85 
 
 		 280 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 289 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  22.13 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  33.8 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>