112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0145 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  42.13 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  43.78 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  42.28 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 221 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.4 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  35.93 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  39.44 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  37.13 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.08 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.86 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  22.53 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0509  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.5 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.591495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.46 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  26.64 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  25.87 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  25.43 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 310 aa  62  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  23.58 
 
 		 277 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  23.39 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  25.81 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  27.75 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  35.93 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.58 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.46 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  21.01 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.78 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 278 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  23.9 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  40.7 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3599  hypothetical protein  28.99 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.15 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0516  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0659  hypothetical protein  28.99 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0955  hypothetical protein  28.99 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3571  hypothetical protein  28.99 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1925  hypothetical protein  28.99 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  18.44 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 351 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  23.83 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.88 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3589  AraC/XylS family transcription factor  28.5 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  21.01 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  21.93 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  20.86 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  40.51 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.58 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.45 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  21.1 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.73 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.18 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  27.18 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  26.26 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>