More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2330 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  96.08 
 
 		 306 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  94.08 
 
 		 304 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  93.18 
 
 		 308 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  72.7 
 
 		 298 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  69.64 
 
 		 296 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  67.43 
 
 		 253 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  30.25 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  28.2 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  22.68 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  21.32 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  44.59 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  31.36 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  24.65 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  31.36 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  39.33 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.25 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  38.1 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  38.1 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  39.29 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  33.12 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.54 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  36.9 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  35.71 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  35.71 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  19.92 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  35.29 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.75 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  36 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  32.05 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  37.76 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>