284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4151 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6197  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 272 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.29 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  24.59 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.31 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  33.97 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.63 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  29.3 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.91 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.95 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.8 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  31.38 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.16 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  48.19 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.86 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.97 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  27.83 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.82 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 304 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 309 aa  62  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24.42 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  23.37 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.22 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.66 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  28.65 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  28.33 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.11 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 355 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>