97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1713 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40.68 
 
 		 289 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.99 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  29.78 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.86 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  34.64 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.99 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  21.89 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  28.51 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  26.6 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  21.91 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.43 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  21.78 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3824  transcriptional regulator, AraC family  22.92 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  20.89 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  20.81 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  20.38 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.76 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  22.22 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  27.82 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  21.35 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  18.58 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.87 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  21.29 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  21.56 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.73 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  23.56 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 160 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  23.7 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  23.5 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  30.5 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0792  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 163 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  23.68 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.44 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  24.34 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>