132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3824 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3824  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 276 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  25.56 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  22.9 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.78 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  22.3 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  22.39 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  22.61 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  23.3 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.35 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  20.1 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  22.51 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  21.39 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.22 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  23.2 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  23.73 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.02 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  21.01 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  21.05 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.88 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.05 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  23.61 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  21.43 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 349 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  22.61 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  22.55 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  20.85 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  20.08 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  22.63 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  29.79 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  23.89 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 324 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  34.21 
 
 		 327 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 362 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  22.51 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  22.99 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  19.78 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  20.9 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  30.26 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  22.92 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  28.41 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>