More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0546 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  497  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  85.6 
 
 		 256 aa  417  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  85.21 
 
 		 257 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  43.36 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.95 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.52 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 281 aa  85.5  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  30.77 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.46 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.9 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.44 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  29.11 
 
 		 277 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  26.04 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  25.15 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  25.86 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.33 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.13 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  26.72 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.79 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2143  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.74 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  19.84 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  36.59 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.29 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  21.63 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  38.96 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3775  AraC-like transcriptional regulator  39.51 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  22.05 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  28.96 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  39.51 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.86 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  42.5 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2980  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>