46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2143 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2143  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2980  transcriptional regulator, AraC family  51.88 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.91 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  24.86 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  29.89 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  27.43 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.26 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  19.59 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  24.12 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  28.79 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.35 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  23.45 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  21.62 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  20.48 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.94 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.91 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  32.1 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.78 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  20 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  21.97 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  20.96 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  23.81 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2509  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  19.28 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  24.79 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>