More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3504 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 281 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  37.09 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  25.87 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.44 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.17 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.21 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  24.19 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  24.89 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  23.92 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.88 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  22.81 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  22.62 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.73 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  38.39 
 
 		 160 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  22.6 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  21.93 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  24.35 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  23.56 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  26.7 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  24.19 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2336  hypothetical protein  26.47 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  23.26 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  22.73 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  21.94 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  24.05 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.78 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  36 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.46 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2332  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000141159  normal  0.457995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.1 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>