257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4438 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  524  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.95 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  23.51 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  26.72 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.75 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  25.81 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  24.7 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  37.31 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 123 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  22.87 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  22.45 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  32.17 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  36.56 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  20.95 
 
 		 289 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 537 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  35.82 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  23.08 
 
 		 304 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 359 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  34.33 
 
 		 126 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 146 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 143 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 319 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  30.16 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 331 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 307 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  25.55 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.99 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  28.85 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  33.61 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3290  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 324 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>