More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2016 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 308 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  94.16 
 
 		 304 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  93.18 
 
 		 304 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  93.83 
 
 		 306 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  72.4 
 
 		 298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  66.99 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  68.08 
 
 		 296 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  30.18 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 272 aa  89.4  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  21.32 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  22.46 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  36.5 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  34.16 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  33.97 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  33.33 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  33.33 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  44.59 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  31.36 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  32.69 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  31.36 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  32.05 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  32.05 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  31.98 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  31.61 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  25.84 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  32.54 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  31.61 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.87 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.63 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  36.63 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  36 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  37.37 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  21.62 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  37.23 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  39.8 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  43.24 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  24 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>