More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1914 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  74.34 
 
 		 304 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  72.88 
 
 		 306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  72.4 
 
 		 308 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  72.7 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  63.85 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  63.51 
 
 		 296 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  65.1 
 
 		 253 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  29.56 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 272 aa  89  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  23.25 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  29.44 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  36.04 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  35.34 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  34.23 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  24.64 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  34.23 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  34.23 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  24.86 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  37.5 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  37.5 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  38.82 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  24.7 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  39.29 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  37.84 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  31.82 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  22.9 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  38.1 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  31.82 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  23.37 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  45.78 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  41.46 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  39.29 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  32.95 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  32.95 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  32.95 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  32.95 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  32.95 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  32.95 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  36.99 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  40.79 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  36.13 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  36.73 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  29.66 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.86 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>