150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2016 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.83 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  26.05 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  24.71 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  41.86 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  22 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  20.82 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.76 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  19.77 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  22.57 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  22.71 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  22.98 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.98 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  23.19 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  20.33 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  19.32 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  24.52 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  21.31 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  22.62 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  25.31 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  21.74 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  21.2 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.81 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  19.07 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  23.3 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3767  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 371 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  24.06 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 360 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  18.18 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  20.94 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 356 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 382 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  24.36 
 
 		 343 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  18.18 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  24.36 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  20.89 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  18.58 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  23.81 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  20.27 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 357 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 337 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 357 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 360 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  34.21 
 
 		 396 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 396 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 410 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 285 aa  45.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  18.35 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  30.26 
 
 		 337 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>