More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4318 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 267 aa  511  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.12 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40.64 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  21.05 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  23.29 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.21 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  33.91 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  30.98 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  24.54 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.31 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  33.03 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  24.63 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  21.84 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  41.86 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  23.6 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  22.08 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  31.28 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  44.44 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  19.32 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  29.91 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  24.83 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40.96 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.73 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 393 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  25.4 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  45.12 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  25.33 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>