More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2581 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 300 aa  564  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 287 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  51.23 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.46 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.79 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  35.82 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  31.84 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  24.14 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.8 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.79 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1472  transcriptional regulator, AraC family  51.3 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.7 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  37.66 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.73 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  24.59 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  23.59 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  20 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  18.69 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  21.97 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.11 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  23.19 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  30.15 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  23.56 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  23.31 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.9 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.42 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 143 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3824  transcriptional regulator, AraC family  23.47 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>