48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1690 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1690  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 363 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3867  putative transcriptional regulator  65.06 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0433  hypothetical protein  63.4 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3644  AraC family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0627026  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  25.85 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  35.38 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  31.25 
 
 		 246 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 256 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  22.86 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  22.41 
 
 		 281 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 289 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.08 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.61 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6267  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 246 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 296 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  54.55 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.61 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 1121 aa  43.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 151 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  36.36 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2022  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 282 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0521834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 264 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>