35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3644 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3644  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 379 aa  754    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0627026  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3867  putative transcriptional regulator  54.64 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1690  AraC family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0433  hypothetical protein  53.27 
 
 		 310 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  33.75 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  37.35 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 309 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.22 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  37.8 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 275 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  52.38 
 
 		 276 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 304 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.56 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  20.81 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  51.35 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  30.26 
 
 		 278 aa  43.9  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 198 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 282 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 325 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 256 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>