24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3867 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3867  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  626  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1690  AraC family transcriptional regulator  65.06 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0433  hypothetical protein  60.8 
 
 		 310 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3644  AraC family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 379 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0627026  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  32.5 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2022  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0521834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  23.86 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  21.94 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  20.47 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.83 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 271 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>