More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2050 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
284 aa  586  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3015  transcriptional regulator  38.18 
 
 
283 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103584  normal  0.15969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5606  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 
279 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0545512  normal  0.986843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.36 
 
 
272 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.27 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.27 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.27 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.27 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  27.27 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.27 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.27 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0837  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  27.7 
 
 
287 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.36 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.36 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.36 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.36 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.36 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1147  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  26.69 
 
 
280 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0420293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1094  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  26.69 
 
 
276 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3571  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  26.69 
 
 
276 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000174355  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0738  transcriptional activator RhaR  25.17 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0386443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  47.37 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  26.77 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  25.3 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3753  transcriptional activator RhaR  25.17 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.890732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3841  transcriptional activator RhaR  24.14 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  25.51 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  25.51 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3607  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  21.61 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4262  transcriptional activator RhaS  25.69 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  20.85 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4297  transcriptional activator RhaS  26.09 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.082999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  23.96 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  24 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0197402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  23.95 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5358  transcriptional activator RhaS  27.6 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4377  transcriptional activator RhaS  23.6 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03791  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  27.6 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4079  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4291  transcriptional activator RhaS  23.6 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4112  transcriptional activator RhaS  27.6 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4443  transcriptional activator RhaS  24.9 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03740  hypothetical protein  27.6 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  46.05 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  27.6 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4065  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209723  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4437  transcriptional activator RhaS  26.4 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  22.18 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.19 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 
301 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4384  transcriptional activator RhaS  27.2 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1161  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 
190 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000709496  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4299  transcriptional activator RhaR  23.59 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
378 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  20.33 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  20.08 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
440 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  39.73 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.68 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4444  transcriptional activator RhaR  21.74 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 
129 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 
285 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1802  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4111  transcriptional activator RhaR  34.57 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4078  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4439  transcriptional activator RhaR  34.57 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  29.1 
 
 
387 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03741  hypothetical protein  34.57 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5360  transcriptional activator RhaR  34.57 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 
326 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 
1201 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4136  transcriptional activator RhaR  34.57 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>