168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2793 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2026  transcriptional regulator, AraC family  33.18 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0545338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2706  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28935 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05740  hypothetical protein  30.95 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.13 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  40.85 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  47.83 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3143  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.828512  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  42.47 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4632  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 272 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 305 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 279 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.12 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 131 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  46.27 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  43.24 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40.54 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 294 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.58 
 
 		 319 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  42.47 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 274 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 304 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 277 aa  48.5  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 278 aa  48.5  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 143 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 143 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  41.89 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.76 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.5 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  45.9 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.25 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  20.95 
 
 		 415 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 151 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  30.56 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 112 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0746  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  40.3 
 
 		 289 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  34.72 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 292 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  38.89 
 
 		 275 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1947  two component transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 		 252 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  41.67 
 
 		 300 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 274 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 277 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 306 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 291 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>