66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2706 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2706  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 236 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2026  transcriptional regulator, AraC family  72.93 
 
 		 251 aa  321  8e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0545338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4632  AraC family transcriptional regulator  72.41 
 
 		 235 aa  310  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3143  helix-turn-helix domain-containing protein  76.85 
 
 		 203 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.828512  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05740  hypothetical protein  46.58 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  38.46 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 361 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 308 aa  45.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 360 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  31.08 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  31.86 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  34.74 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 396 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  35.14 
 
 		 396 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 1121 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 360 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 357 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 357 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 410 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  35.82 
 
 		 353 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 360 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  42.67 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 317 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 350 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 309 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 356 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 355 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 271 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  34.33 
 
 		 352 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.669578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>