25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4632 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4632  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2706  transcriptional regulator, AraC family  72.41 
 
 		 236 aa  323  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2026  transcriptional regulator, AraC family  67.39 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0545338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3143  helix-turn-helix domain-containing protein  72.91 
 
 		 203 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.828512  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05740  hypothetical protein  44.75 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 317 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  28 
 
 		 330 aa  45.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 131 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.95 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  35.82 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4901  AraC family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 134 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 123 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 261 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 308 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>