44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05740 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05740  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2706  transcriptional regulator, AraC family  46.58 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2026  transcriptional regulator, AraC family  45.79 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0545338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3143  helix-turn-helix domain-containing protein  47.67 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.828512  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4632  AraC family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  20.26 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  33.33 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  33.33 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  33.64 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 296 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5753  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  35.9 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  38.1 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 278 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 123 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.65 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1191  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0616  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 247 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 272 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 254 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 278 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>