More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1012 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1012  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 274 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1546  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000827637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  25.48 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.59 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.83 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  36.63 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.64 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.91 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.64 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.91 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.55 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2912  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  24.55 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  26.74 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  29.23 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  26.53 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  29.32 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.47 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.96 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  23.73 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  23.68 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  25 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>