More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2884 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2884  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  28.63 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  22.38 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  21.51 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  24.08 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3418  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 97 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  23.49 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  40.24 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  41.46 
 
 		 1374 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  35.96 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.25 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 519 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.97 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.97 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  17.65 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.78 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.17 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  23.45 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  20.97 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000422  transcriptional regulator AraC/XylS family  33.75 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  41.46 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.2 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.2 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.39 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  22.03 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4444  transcriptional activator RhaR  26.87 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  22.27 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4378  transcriptional activator RhaR  27.61 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 463 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.06 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4292  transcriptional activator RhaR  26.87 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  28.24 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 519 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.39 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  27.06 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 120 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  19.53 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4332  transcriptional activator RhaR  26.87 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0206667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.54 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  34.33 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  24.42 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 126 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4263  transcriptional activator RhaR  26.87 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.73 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 388 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 365 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  37.8 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 600 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  42.03 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>