More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3096 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3096  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  563  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3169  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  62.64 
 
 		 273 aa  368  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.926354 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1294  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2125  AraC family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 292 aa  92.4  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  35.43 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  36.23 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2154  helix-turn-helix domain-containing protein  26.22 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  20.99 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2488  AraC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1732  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  20.08 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6120  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  27.43 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0129  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3383  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0398401  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4826  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3605  hypothetical protein  24.6 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4362  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0826  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1447  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0598  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3025  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3551  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.427792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1416  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3929  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2574  helix-turn-helix domain-containing protein  28.43 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  34.69 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  23.11 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0623  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378679  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3768  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2198  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.983823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.37 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  21.4 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4619  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  35.71 
 
 		 1335 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  24.4 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  18.73 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1103  helix-turn-helix domain-containing protein  24.63 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.403298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 		 1201 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2769  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  20.08 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>