More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1732 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1732  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2154  helix-turn-helix domain-containing protein  59.14 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2125  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  24.2 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4362  helix-turn-helix domain-containing protein  26.82 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3096  helix-turn-helix domain-containing protein  24.52 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  23.73 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3857  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  29.23 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  22.85 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4619  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  30.37 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  30.08 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  24.3 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  22.48 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2211  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3551  helix-turn-helix domain-containing protein  32.08 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.427792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3260  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  27.84 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4330  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0359782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  27.1 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3605  hypothetical protein  39.08 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1737  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2115  transcriptional regulator, AraC family  25.55 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3169  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.926354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0598  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0826  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1447  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2210  transcriptional regulator, AraC family  26.37 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.423817  normal  0.20032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1809  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.74 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000134184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2769  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  32.93 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3025  helix-turn-helix domain-containing protein  29.13 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2448  AraC family transcription regulator  31.68 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  23.56 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.26 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2771  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  31.71 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>