More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3025 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3025  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3551  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.427792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4362  helix-turn-helix domain-containing protein  26.13 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2125  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0598  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3169  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.73 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.926354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0623  transcriptional regulator, AraC family  44.3 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378679  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1294  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2448  AraC family transcription regulator  38.95 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4826  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3096  helix-turn-helix domain-containing protein  25.68 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6120  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3768  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5133  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0705999  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3374  helix-turn-helix domain-containing protein  24.72 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3383  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0398401  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1767  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  38.75 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4278  helix-turn-helix domain-containing protein  28.11 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6594  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.981144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2347  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.52 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  0.205256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3534  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0611769  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0826  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1447  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3135  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4329  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1550  transcriptional regulator, AraC family  39.74 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1308  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0485  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1732  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4701  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4330  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0359782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  27.32 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  36 
 
 		 1343 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  33.33 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0470  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4380  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.072515  decreased coverage  0.000817798 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4619  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6725  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342699  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2324  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  22.37 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>