More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4362 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4362  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3551  helix-turn-helix domain-containing protein  46.82 
 
 		 231 aa  212  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.427792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3025  helix-turn-helix domain-containing protein  37.01 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  28.24 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_002950  PG2125  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4826  helix-turn-helix domain-containing protein  27.57 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1732  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  41.05 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0623  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378679  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0598  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6120  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2428  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26584  normal  0.428085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  39.6 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2154  helix-turn-helix domain-containing protein  25.66 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  30.17 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2832  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 127 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0139724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1416  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4441  helix-turn-helix domain-containing protein  26.89 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1550  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2211  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4329  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3096  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0129  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  33.53 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3374  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6594  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.981144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1694  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5517  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0042541  normal  0.0106671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  24.33 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6410  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2488  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3383  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0398401  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  20.31 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1294  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1389  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4701  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0485  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>