More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2771 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2771  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4619  transcriptional regulator, AraC family  59.11 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4316  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 284 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131308  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  27.2 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5352  transcriptional regulator, AraC family  37.31 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20713  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0263  transcriptional regulator, AraC family  43.62 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7106  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509238  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7085  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.425365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3376  transcriptional regulator, AraC family  42.53 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3797  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00910315  normal  0.099485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1203  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.74 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.375104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1172  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.74 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1183  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.74 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1067  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.74 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1218  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  32.74 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.398586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2115  transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  35.45 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5271  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0620952  normal  0.0372935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  31.21 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  29.2 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  22.05 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  29.2 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  36.19 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  29.2 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2211  transcriptional regulator, AraC family  43.42 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2488  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  25.5 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  42.5 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1346  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4030  helix-turn-helix domain-containing protein  34.87 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  22.03 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  41.43 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5451  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1550  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3892  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2466  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  42.35 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  43.84 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2210  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.423817  normal  0.20032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>