More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2198 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2198  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.983823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3605  hypothetical protein  49.83 
 
 		 291 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3260  AraC family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3857  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2769  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2097  hypothetical protein  28.26 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  26.03 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5541  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2362  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 319 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  26.64 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1346  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0826  AraC family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1447  AraC family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  26.19 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1199  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3383  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0398401  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  24.83 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  22.62 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4615  helix-turn-helix domain-containing protein  22.88 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00567057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  24 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  22.67 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  23.87 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  24.41 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2728  transcriptional regulator, AraC family  23.69 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  24.42 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  25.25 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1558  AraC family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2115  transcriptional regulator, AraC family  23.22 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  24.08 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  24.13 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  20.8 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  21.18 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>